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通过基因组测序来检测感染源

2018-05-25 13:08:04
  基因组测序可以有效检测感染途径。因此,研究人员现在已经成功地追踪了全球范围内的Mycobacterium chimaera疫情。

  由苏黎世大学医院和研究中心Borstel为首的欧洲财团的科学家可以跟踪由基因组测序全球结核分枝嵌合体爆发细节。研究表明,在重症监护室中使用(“暖气散热器单位”)感染与M.嵌合体部落可能来源低温设备从瑞士,德国,荷兰和英国等12名病人21例在美国和澳大利亚都有病。感染发生在心脏手术的一部分,其中低温设备用于调节血液温度。

  Mycobacterium chimaera - 并不总是无害的

  M. chimaera是所谓的非结核分枝杆菌(NTM)之一。这些存在于天然水库中,通常是无害的。然而,在有某些预先存在病症和免疫力低下的个体的人中,NTM细菌可能会引起感染,尤其是在肺部。然而,2013年的初步研究表明,M. chimaera也会引起人造心脏瓣膜的炎症,可能是由心脏污染低温装置在心脏直视手术期间感染引起的。

  为了阐明感染途径,是目前的研究250 M.嵌合体样品中的(心脏患者中,温度控制装置,其它医疗产品,饮水机和在医院自来水系统,以及从生产地点Hypothermiegeräten)通过基因组测序的方法检查。此外,还包括来自瑞士,德国,荷兰和英国的无心脏手术患者的M. chimaera菌株。

  结果显示来自21名感染心脏手术患者的M. chimaera细菌,来自美国和澳大利亚患者的另外12个样品和来自低温设备的大部分样品具有非常相似的相似性,因此强烈指示给共同的来源。

  通过基因组测序调查病原体的爆发

  “基因组测序是研究病原体爆发的有力工具。我们的研究表明,最有可能归因于源全球M.嵌合体爆发,“教授斯特凡尼曼,该研究小组的负责人结合”分子和实验分枝杆菌“的研究中心Borstel和成员卓越集群​​”炎症研究”的结果。苏黎世大学医院的Hugo Sax教授补充说:“该研究还显示,至少有一名患者可能已经感染了医院内的当地污染物。因此手术室应该没有不受控制的水源,以尽量减少感染的一般风险。“

  作者指出,将个别患者与可能导致感染的特定装置联系起来是不可能的。虽然大量样品已经过测试,但自来水,低温设备和设备产生的气溶胶样品数量太少,无法获得准确的传输路径。由于研究中至少有一名患者被潜在的局部污染低温设备感染,作者警告不要及早停止调查,因为其他制造商的温度控制设备和医院供水系统也可能受到污染。

  更好地理解传播机制

  总体而言,M. chimaera感染非常罕见(估计5000名患者中有1名患者在心脏手术期间会在英国感染),但可能会致命。自2013年以来,欧盟,美国和澳大利亚已报告超过100例M. chimaera感染病例。由于这种危害,许多国家已经颁布了减少感染风险的特别指南。

  现在发表的研究提供了关于低温装置和潜在传播途径污染的时间和原因的重要信息,并有助于更好地理解繁殖机制并建立有效的控制措施。

来源:实验与分析

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