全基因组分析发现多个疾病相关基因

　　来自伦敦帝国理工学院的研究人员通过多次全组关联，发现了多个与疾病相关的基因，其中包括了糖尿病，冠心病等现代社会热点关注的疾病，这些成果陆续发表在《Nature Genetics》，《JAMA》等杂志上。

　　第一篇文章中，研究人员找到了控制电信号，也就是控制心律的基因，这种被称为SCN10A的基因受到损伤或突然变异会增加患心脏病的风险。研究人员希望，他们的发现能帮助他们了解人体的心跳如何受到控制，能最终帮助他们找到治疗心律不齐的新办法。

　　脏病是世界上主要的死亡原因，其死亡人数每年约占七百万，英国约有十万。因严重的心律不齐(比如心室纤维性颤动——能导致心跳停止的心脏短路)而突然造成死亡的人数占半数以上。人的心跳受电信号控制，开始于中心地区——心脏起搏器——并环绕心脏肌肉运行。

　　伦敦帝国理工学院的流行病、公共和初级护理部研究报告的John Chambers博士表示，“基因变异就像硬币的两面，一面与增加风险有关，另一面与降低风险有关。我们已经确认了影响心律的基因，基因变异不同的人将增加或降低发展心律问题的风险。”

　　在这项研究中，研究人员分析了近2万人的基因组成，以寻找影响心跳的基因因素。他们研究每个人的心电图(ECG心跳记录)，测量电信号在心脏不同部位运行的时间。研究人员发现，SCN10A基因的变异与缓慢不规则的心律(包括心室纤维性颤动)有关。

　　另外这一研究小组还分证实了基因TMPRSS6与血小板水平有关，他们发现了34个新的遗传位点与血性状特征有关，这一新发现提供了有关遗传位点影响血细胞性状的新认识。这一研究成果公布在《Nature Genetics》杂志上。

　　研究人员对1.6万人的基因图谱和进行了分析。结果显示，基因TMPRSS6控制着人体内的血红蛋白含量。研究对象中既有欧洲人也有亚洲人，说明这一基因的作用在全球人群中广泛存在。

　　血红蛋白是高等体内负责运送氧的一种，如果体内血红蛋白含量过低，就会出现贫血等症状。但如果血红蛋白含量太高，也会增加中风等疾病的风险。

　　研究人员说，如果能研发出增强基因TMPRSS6活动性的药物，就可以提高人体内的血红蛋白含量，帮助治疗贫血症等。同样，如果能用药物抑制该基因的作用，也可以根据需要降低血红蛋白的含量。

　　同样在这一杂志上，伦敦帝国理工学院研究组成员对亚洲印第安人或欧洲血统人进行了广泛的基因组扫描，鉴别出MC4R附近的一个变异增加了糖尿病和胰岛素抗阻的风险。

　　除此之外，研究人员在JAMA杂志上发表的文章通过一项对炎症生物标记C-反应蛋白(CRP)的遗传变异与冠心病之间的分析无法对它们之间的因果关联给予支持。

　　冠心病(CHD)是全世界首要的致死原因。 炎症在CHD每个阶段的发展中(即从病理发展的启动到斑块的破裂)都扮演着关键的作用。 根据文章的背景资料，CRP是目前使用最为广泛的炎症生物学标志。

　　研究人员开展了一项遗传学的相关性研究，旨在寻找影响CRP水平的共同基因位点(即其染色体上某特别基因的特殊位置)并用基因随机化的方法来检验CRP水平与CHD之间可能存在的因果关系。他们首先开展的是在整个基因组范围内的相关性(n=17,967)和复制研究(n = 13,615)以寻找与血浆CRP浓度相关的基因位点。这些数据的收集时间在1989年至2008年之间，而基因型的决定是在2003年至2008年之间。

　　研究人员发现，目前的在基因组范围内的相关性研究证实了LEPR, IL6R, CRP 和HNF1A 位点及APOE-CI-CII 集簇中的普通的基因变异与CRP浓度之间存在着相关性。但是，SNP rs7553007次要等位基因(某基因的一种替代形式)和在纳入我们的孟德尔随机研究中的CRP位点中的其它的变异则与CHD风险之间没有关联。”

　　他们得出结论：“总而言之，我们的对超过28,000例患者样本和100,000例对照样本的孟德尔随机化研究发现，CRP位点变异与CHD之间没有关联性，因此不支持其与粥样硬化中的CRP之间具有因果关系。而且，这一研究提示，开发针对降低血浆CRP浓度的治疗策略不太可能会有效果。”

　

　　Genome-wide association study identifies variants in TMPRSS6 associated with hemoglobin levels

　　We carried out a genome-wide association study of hemoglobin levels in 16,001 individuals of European and Indian Asian ancestry. The most closely associated SNP (rs855791) results in nonsynonymous (V736A) change in the serine protease domain of TMPRSS6 and a blood hemoglobin concentration 0.13 (95% CI 0.09–0.17) g/dl lower per copy of allele A (P = 1.6 10-13). Our findings suggest that TMPRSS6, a regulator of hepcidin synthesis and iron handling, is crucial in hemoglobin level maintenance.

　　Genetic Loci Associated With C-Reactive Protein Levels and Risk of Coronary Heart Disease

　　Context Plasma levels of C-reactive protein (CRP) are independently associated with risk of coronary heart disease, but whether CRP is causally associated with coronary heart disease or merely a marker of underlying atherosclerosis is uncertain.Objective To investigate association of genetic loci with CRP levels and risk of coronary heart disease.

　　Design, Setting, and Participants We first carried out a genome-wide association (n = 17 967) and replication study (n = 13 615) to identify genetic loci associated with plasma CRP concentrations. Data collection took place between 1989 and 2008 and genotyping between 2003 and 2008. We carried out a mendelian randomization study of the most closely associated single-nucleotide polymorphism (SNP) in the CRP locus and published data on other CRP variants involving a total of 28 112 cases and 100 823 controls, to investigate the association of CRP variants with coronary heart disease. We compared our finding with that predicted from meta-analysis of observational studies of CRP levels and risk of coronary heart disease. For the other loci associated with CRP levels, we selected the most closely associated SNP for testing against coronary heart disease among 14 365 cases and 32 069 controls.

来源：实验与分析