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LIMS仪器接口在实验室自动化管理中的应用

2018-05-31 10:02:10
随着政府部门和企业的信息化的进一步深入,LIMS的应用领域也愈来愈广,其已经成为现代化实验室管理不可或缺的工具。但是一个成功的LIMS实施,才能为用户带来效益。影响LIMS实施成功的因素很多,仪器数据的自动获取就是其中重要的因素之一。本文就从仪器数据获取以及仪器数据应用方面提出了一些方案,以保证LIMS仪器接口的成功实施。

LIMS即“Laboratory Information Management Systems”的缩写,也就是实验室信息系统管理系统。LIMS将实验室的分析仪器通过计算机网络连起来,采用科学的管理思想和先进的数据库及软件技术,实现以实验室为核心的整体环境的全方位管理。它集样品管理,资源管理,事务管理,网络管理,数据管理(采集、传输、处理、输出、发布、分析),报表管理等诸多模块为一体,组成一套完整的实验室综合管理和产品质量监控体系,既能满足外部的日常管理要求,又能保证实验室分析数据的严格管理和控制[1]。

随着科研和生产技术的不断发展,人们对分析测试的要求无论在样品数量、分析周期、分析项目和数据准确性等方面都提出了更高的标准,而原来的人工管理模式在这种形式下已显得不太适应。为此,国际上相关实验室均已开始朝网络化管理的方向发展。实验室信息管理系统(LIMS) 就是在这一背景下产生的集现代化管理思想与计算机技术为一体的用于各行业实验室管理和控制的一项崭新的应用技术。

当今社会信息化程度已经相当高,传统的手工录入数据,纸张式的数据管理模式已经不能满足客户的需求;基于电子表格的管理,无法解决不同数据之间的相互关联问题。这些都会导致实验室数据的数据利用率低,管理难度加大。因此,除了加强实验室自身专业水准,提高实验室的管理水准已经是唯一的选择。这里,LIMS的引入无疑会把实验室的管理水平提升到信息时代的最高水平。

LIMS的发展主要经历了一下几个时期:


图 1. LIMS与仪器工作站双向传输。

在仪器工作站上,其数据必须共享,并赋予接口程序可读写的权限,这样接口程序可以通过此目录与仪器操作软件进行数据交换。当样品到达实验室,经实验室人员确认后,系统会判断当前样品中是否含有此类仪器的任务。如果存在此类仪器的任务,系统会根据接口配置信息,找到任务所对应的仪器,将任务下达到对应仪器的工作站 (步骤一)。任务中除了样品的信息,还能包括测试的条件,如温度,时间等信息。工作站将任务经过转换,传达给仪器(步骤二)。仪器接到任务,按要求进行分析,分析完毕后,将结果传送给工作站(步骤三)。仪器工作站会将测试结果传送到数据目录,由接口程序发送到系统中(步骤四)。

LIMS与仪器工作站的单向传输

对于此种接口,系统直接读取其结果文件,将数据的结果传输到LIMS中;

此种仪器的接口通讯的示意图如下:

图 2 .LIMS与仪器工作站仪器单向传输。
图 2 .LIMS与仪器工作站仪器单向传输。

在仪器工作站上,数据也必须共享,并赋予接口程序可读写的权限,这样接口程序可以通过此目录与仪器操作软件进行数据交换。当样品到达实验室,经实验室人员确认后,有实验室人员讲分析任务下达给仪器 (步骤一)。仪器接到任务,按要求进行分析,分析完毕后,将结果传送给工作站(步骤二)。仪器工作站会将测试结果传送到数据目录,由接口程序发送到系统中(步骤三),发送成功之后数据将会归档。

LIMS与无工作站仪器相连

这些仪器由一个共同点:没有相应的仪器操作软件。通常这类仪器通过RS232/RS485与外部通讯。为了能将仪器统一管理,可以通过转换器将仪器接口转化成以太网接口,通过以太网协议与LIMS系统进行接口。

此种接口的示意图如下:

图 3 .LIMS与仪器与无工作站仪器单向传输。
图 3 .LIMS与仪器与无工作站仪器单向传输。

对于此种仪器,它只能通过RS232接口与外界进行数据交换。为了能更方便实验室对数据进行管理,我们采用了RS232-TCP/IP的转换器,让用户通过以太网与仪器设备进行数据交换。

具体流程如下:实验室人员拿到样品,通过工作站在LIMS系统中找到相应的样品(步骤一)。实验室人员对仪器设备进行操作,得到实验室数据,将数据通过网络传送到工作站中选定的样品(步骤二),工作站将数据传送到LIMS系统(步骤三)。

LIMS仪器接口带来的好处

仪器的接口为实验室的自动化管理提供了方便,主要集中在以下几点:一是帮助实验室实现的自动化,二是帮助实验室统计实验室仪器的使用率。

实验室的自动化

通过仪器接口程序,LIMS可以直接将测试任务,测试条件等输入仪器;在测试完毕之后,可以自动从仪器获取数据。一方面减少了由于人为因素导致的出错,另一方面也减轻了实验室人员的结果输入负担,使他们能更加专注于业务本身。

仪器使用率的统计

标准的LIMS系统并不提供仪器使用率模块,但是通过数据挖掘技术,这些信息可以通过LIMS数据库中各种数据的关联得到。所谓数据挖掘,就是从大量的、不完全的、有噪声的、模糊的、随机的实际应用数据中,提取隐含在其中的、人们事先不知道的、但又是潜在有用的信息和知识的过程[2]。在LIMS数据库中,通过仪器接口,可以得到每个数据具体来自于哪台仪器,这样,从样品到达实验室时间算起,到获得计算结果时间,这段时间就是该台仪器被占用的时间。通过报表,可以统计每台仪器每天,每个月,每年的工作时间计算。

仪器控制图

当仪器正常运行一段时间之后,难免会出现一些偏差。这种偏差很多时候不能由单个控制样分辨出来,需要通过一段时间控制样的数据,进行数学分析之后才能进行识别。LIMS无缝集成的控制图模块就能帮助用户把控制数据从数据库取出,产生控制图,提供仪器工作状态的科学依据。

小结

仪器接口实施成功与否,是LIMS实施成败的关键因素之一。仪器接口将减少人为原因导致的数据出错,减少实验室人员的负担,实现数据获取的自动化。但是,仪器接口并不是LIMS项目的全部,成功的LIMS实施还涉及到实验室管理流程的改造,报表的设计,与其他系统的接口,其它实验室资源的管理模块等。但是成功仪器实施,可以极大鼓舞用户对LIMS的信心,为整个LIMS项目的实施带来积极的影响。

来源:实验与分析

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